MotoGP第15戦日本GP、Moto3クラスは、栃木県のツインリンクもてぎで2日目の予選を行ない、ニッコロ・ブレーガ（KTM）が2分09秒320でポールポジションを獲得した。

Moto3クラスの予選は雨はほぼ上がっているものの、気温14度、路面温度17度のウエットコンディションで争われた。今ウイークの各セッションで上位につけていたブレーガは、セッション序盤の開始9分すぎにリーダーボードのトップに立つ。その後、アルベルト・アレナス（KTM）、鈴木 竜生（ホンダ）、ロマーノ・フェナティ（ホンダ）、アロン・カネト（ホンダ）がリーダーボードのトップに立つが、開始29分すぎにブレーガはトップの座を奪還。さらにその後も3回ファステストを更新し、最後のアタックで2分09秒320を記録して今シーズン初となるポールポジションを獲得した。ブレーガのポールポジション獲得は2016年のスペインGP以来、グランプリ通算2回目となる。

2番手に2分09秒592でニッコロ・アントネッリ（KTM）。アントネッリも最後のアタックで自己ベストを更新、KTMが予選ワンツーを獲得。アロン・カネト（ホンダ）が2分09秒708で3番手と前戦アラゴンGPに続いてフロントロウを獲得。

4番手に2分09秒797でマルコ・ベゼッチ（マヒンドラ）が続き、グランプリベストグリッドを獲得。5番手に2分09秒846でエネア・バスティアニーニ（ホンダ）、フェナティは2分09秒881で6番手。7番手に2分10秒152でホルヘ・マルティン（ホンダ）、8番手に2分10秒227でガブリエル・ロドリゴ（KTM）、9番手に2分10秒305でマニュエル・パグリアーニ（マヒンドラ）、10番手に2分10秒320でアレナスの順で続いた。

タイトルに王手をかけたホアン・ミル（ホンダ）は2分10秒580で14番手だが、前戦アラゴンGP決勝でのペナルティにより、6グリット降格で20番グリッドからのスタートとなる。

日本勢では、午前中のフリー走行3回目では2番手につけ、予選でも開始16分すぎにリーダーボードのトップに立った鈴木は、最後のアタックで自己ベストとなる2分10秒737を記録して15番手。ただし、ミルの降格により14番グリッドからのスタートとなる。ルーキーの佐々木 歩夢（ホンダ）は2分11秒298で24番手、鳥羽 海渡（ホンダ）は2分11秒999で28番手から初のホームレースをスタートする。

なお、予選10番手のアレナスだが、予選セッション中盤に最終コーナーで転倒し、右手を骨折。決勝を欠場する模様。これにより10番手以下のグリッドが変更となる見込み。